1. Project Information
📄 Project Information Page
보고서 파일을 열었을 때 가장 먼저 보이는 페이지로, 고객님의 서비스 요청으로 분석을 진행한 시료 및 그룹 정보, NGS 기반의 염기서열 분석을 진행한 뒤 생성된 데이터 결과, 그리고 Workflow Summary를 확인할 수 있는 페이지입니다.
Analysis Information
분석 의뢰 시료 및 그룹 정보를 확인할 수 있습니다.
Sample Type : 분석 시료의 종류
Sample Count : 분석 시료의 개수 및 원시 데이터(rawdata) 개수
Group Count : 분석 그룹의 개수
Group Info : 분석 그룹 및 그룹 내의 시료에 대한 상세 정보(그룹 이름, 그룹 내 시료 개수 및 이름)
Note : 분석 프로젝트에 대한 비고 사항
Sequencing Information
분석 시료에 대한 염기서열 분석 기본 정보를 확인할 수 있습니다.
Platform : 16S rRNA sequencing platform(e.g. Illumina Miseq)
Library Kit : 16S rRNA sequencing library preparation library kit
Library QC : Qualitative Kit for 16S rRNA sequencing(e.g. dsDNA 910 Reagent Kit, 35bp - 1,500bp (AATI))
Read Length : NGS run format(e.g. 300 Paired End)
Additional Info :
Workflow Summary
마이크로바이옴 분석은 NGS 기반으로 생성된 데이터를 이용하여 제공합니다. Project Information page 내 Sequencing Information에 작성되어 있는 내용을 바탕으로 생성된 원시 데이터를 이용하여 데이터 정제(Demultiplexing, Chimera filtering 등), Feature Clustering 등 기본적인 분석을 수행하고, 시료 및 그룹 별 미생물 균총의 분포도를 분석하기 위해 추가 분석들을 수행합니다.
Demultiplexing & Quality Filtering
분석을 수행하기 위한 데이터 정제 과정(Data filtering)
Feature Clustering & Taxonomy Assignment
다양한 공공 데이터베이스를 정제한 쓰리빅스 고유의 데이터베이스를 기반으로 데이터 내 미생물 균총 파악
Diversity Analysis
그룹 간의 미생물 균총의 분포도를 비교 분석
시료 별 미생물 균총의 분포도 유사성 확인
Additional Analysis
미생물 분포도에 따른 분자생물학적 기능 예측
논문에서 자주 인용되는 다양한 추가 분석 결과 제공