[OPEN-KO] Microbiome Analysis Guide Book
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  • Microbiome analysis user guide book
  • I. INTRODUCTION
    • 1. Prologue
    • 2. Report & Raw data Download
    • 3. Analysis Report Template
  • II. PROJECT INFORMATION
    • 1. Project Information
  • III. NGS SEQUENCING
    • 1. NGS Statistics
  • IV. TAXONOMY ANALYSIS
    • 1. Taxonomy Summary
    • 2. Krona Chart
  • V. DIVERSITY ANALYSIS
    • 1. α-Diversity
      • Additional Information
    • 2. β-Diversity
    • 3. LEfSe
    • 4. Heatmap
  • Ⅵ. FUNCTIONAL ANALYSIS
    • 1. Functional Profile
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  • Ⅶ. ADDITIONAL ANALYSIS
    • 1. Phylogenetic tree with Statistics
  • + REFERENCE
    • 1. Reference
    • 2. Database Version
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  1. V. DIVERSITY ANALYSIS

1. α-Diversity

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Last updated 1 year ago

Alpha-Diversity page

생태학에서 (ɑ-diversity)이란 국지적 규모의 서식지에서 평균 종 다양성을 의미합니다. 단일 군집 내의 종 수를 의미하며, 시료 또는 그룹에 얼마나 많은 다양한 미생물들이 분포되어 있는지 확인할 수 있는 지표입니다. Shannon, Simpson 등 다양한 알파 다양성 지수를 이용하여 종의 다양성을 확인할 수 있으며, 특히 마이크로바이옴 분석에서 많이 사용되고 있는 알고리즘은 Shannon 입니다.

가이드북 정보 제한

본 가이드북은 쓰리빅스의 서비스를 신청하지 않은 일반 연구자를 대상으로 공개한 자료입니다. 분석결과 보고서 내 세부 설명 및 내용은 제한적이며, 분석결과를 제공받은 연구자를 대상으로 각 페이지별 상세 설명과 전체 내용이 공개된 가이드북을 제공합니다.

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알파 다양성
Alpha-Diversity page