[OPEN-KO] Microbiome Analysis Guide Book
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  • Microbiome analysis user guide book
  • I. INTRODUCTION
    • 1. Prologue
    • 2. Report & Raw data Download
    • 3. Analysis Report Template
  • II. PROJECT INFORMATION
    • 1. Project Information
  • III. NGS SEQUENCING
    • 1. NGS Statistics
  • IV. TAXONOMY ANALYSIS
    • 1. Taxonomy Summary
    • 2. Krona Chart
  • V. DIVERSITY ANALYSIS
    • 1. α-Diversity
      • Additional Information
    • 2. β-Diversity
    • 3. LEfSe
    • 4. Heatmap
  • Ⅵ. FUNCTIONAL ANALYSIS
    • 1. Functional Profile
      • KEGG page
  • Ⅶ. ADDITIONAL ANALYSIS
    • 1. Phylogenetic tree with Statistics
  • + REFERENCE
    • 1. Reference
    • 2. Database Version
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  1. I. INTRODUCTION

3. Analysis Report Template

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Report Template

쓰리빅스는 하나의 보고서 파일 내에 다양한 분석 결과를 쉽게 확인할 수 있도록 html 형태로 제공하고 있습니다.


Basic Information

좌단의 메뉴바에서 분석 의뢰 기본 정보를 확인할 수 있습니다.

  • Service ID : 프로젝트 번호 및 16S rRNA region 정보

  • Customer Info : 서비스 의뢰 고객님의 성함 및 소속 기관

  • Report Info : 보고서 발송 날짜 및 분석에 이용한 데이터베이스 버전 정보


Report Menu Bar

좌단의 메뉴바를 통해 Taxonomy, Diversity, Functional 등의 다양한 분석 결과, 그리고 분석 보고서 가이드북을 확인할 수 있습니다.

  • Documentation : 마이크로바이옴 분석 보고서 가이드북(3BIGS NGS Service guide book) (마이크로바이옴 분석에서 활용한 참조 논문 및 쓰리빅스의 데이터베이스 정보 포함)

마이크로바이옴 분석에 활용한 Database 버전 정보는 에서 확인할 수 있습니다.

: 마이크로바이옴 분석 및 염기서열 분석 결과 정보, 분석 파이프라인 워크플로우 요약 정보

: 데이터 전처리 과정 및 데이터 서열 통계와 품질 정보에 대한 요약 정보

: 마이크로바이옴 분석 결과, 미생물 균총의 분류학적 정보와 미생물 종에 대한 기초 정보, 그리고 Krona Chart 결과

: Alpha-Diversity, Beta-Diversity, LEfSe, Heatmap 분석 결과

: Tax4Fun2, Picrust2 분석 도구를 활용한 Metabolic functional profile 예측 결과

: Phylogenetic tree 분석을 통한 미생물 군집 구성 결과

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