[OPEN-KO] Microbiome Analysis Guide Book
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  • Microbiome analysis user guide book
  • I. INTRODUCTION
    • 1. Prologue
    • 2. Report & Raw data Download
    • 3. Analysis Report Template
  • II. PROJECT INFORMATION
    • 1. Project Information
  • III. NGS SEQUENCING
    • 1. NGS Statistics
  • IV. TAXONOMY ANALYSIS
    • 1. Taxonomy Summary
    • 2. Krona Chart
  • V. DIVERSITY ANALYSIS
    • 1. α-Diversity
      • Additional Information
    • 2. β-Diversity
    • 3. LEfSe
    • 4. Heatmap
  • Ⅵ. FUNCTIONAL ANALYSIS
    • 1. Functional Profile
      • KEGG page
  • Ⅶ. ADDITIONAL ANALYSIS
    • 1. Phylogenetic tree with Statistics
  • + REFERENCE
    • 1. Reference
    • 2. Database Version
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Microbiome analysis user guide book

쓰리빅스는 최적화된 마이크로바이옴 분석도구와 데이터베이스를 활용한 파이프라인을 이용하여 고객님이 쉽고 간편하게 분석결과를 확인할 수 있도록 지원하고 있습니다. 본 웹페이지는 마이크로바이옴 분석에서 활용한 Database, Method, Statistics 등의 모든 Reference 정보 및 3BIGS Database의 버전 정보를 확인할 수 있습니다.

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Description
I. INTRODUCTION

마이크로바이옴의 전반적인 개요, 마이크로바이옴 분석 보고서 구성 및 다운로드 방법을 소개합니다.

II. PROJECT INFORMATION

마이크로바이옴 분석 프로젝트 정보, 분석 정보, 염기서열 분석 정보, 그리고 Workflow Summary를 제공합니다.

III. NGS SEQUENCING

차세대 염기서열 분석기술(NGS)로 생성된 원시 데이터를 이용한 전처리 과정 및 데이터 서열 통계와 품질 정보에 대한 요약 정보를 제공합니다.

IV. TAXONOMY ANALYSIS

마이크로바이옴 분석 결과, 시료에 포함된 미생물 균총의 분류학적 정보와 미생물 종에 대한 기초 정보, 그리고 Krona Chart 결과를 제공합니다.

V. DIVERSITY ANALYSIS

Alpha-Diversity, Beta-Diversity, LEfSe, Heatmap 분석 결과를 제공합니다.

Ⅵ. FUNCTIONAL ANALYSIS

다양한 분석 도구를 활용한 Metabolic functional profile 예측 결과를 제공합니다.

Ⅶ. ADDITIONAL ANALYSIS

Phylogenetic tree 분석을 통한 미생물 군집 구성 결과를 제공합니다.

+ REFERENCE

마이크로바이옴 분석에서 활용한 Reference 정보 및 3BIGS Database의 버전 정보를 확인할 수 있습니다.

가이드북 정보 제한

본 가이드북은 쓰리빅스의 서비스를 신청하지 않은 일반 연구자를 대상으로 공개한 자료입니다. 분석결과 보고서 내 세부 설명 및 내용은 제한적이며, 분석결과를 제공받은 연구자를 대상으로 각 페이지별 상세 설명과 전체 내용이 공개된 가이드북을 제공합니다.

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