[OPEN-KO] Microbiome Analysis Guide Book
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  • Microbiome analysis user guide book
  • I. INTRODUCTION
    • 1. Prologue
    • 2. Report & Raw data Download
    • 3. Analysis Report Template
  • II. PROJECT INFORMATION
    • 1. Project Information
  • III. NGS SEQUENCING
    • 1. NGS Statistics
  • IV. TAXONOMY ANALYSIS
    • 1. Taxonomy Summary
    • 2. Krona Chart
  • V. DIVERSITY ANALYSIS
    • 1. α-Diversity
      • Additional Information
    • 2. β-Diversity
    • 3. LEfSe
    • 4. Heatmap
  • Ⅵ. FUNCTIONAL ANALYSIS
    • 1. Functional Profile
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  • Ⅶ. ADDITIONAL ANALYSIS
    • 1. Phylogenetic tree with Statistics
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    • 1. Reference
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  1. V. DIVERSITY ANALYSIS

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한 생태계의 평균 종 다양성을 알파 다양성이라고 하면, 서식지 간의 종 다양성을 이라고 합니다. 종 조성이 다양한 환경 기울기에 따라 얼마나 변하고 그 다양성이 차이가 있는지 확인하는 방법이며, 각 시료 및 그룹 간의 거리 측도를 계산하여 종 간의 연관성을 밝힐 수 있습니다. 분석 알고리즘은 주로 Bray-Curtis를 활용합니다.

가이드북 정보 제한

본 가이드북은 쓰리빅스의 서비스를 신청하지 않은 일반 연구자를 대상으로 공개한 자료입니다. 분석결과 보고서 내 세부 설명 및 내용은 제한적이며, 분석결과를 제공받은 연구자를 대상으로 각 페이지별 상세 설명과 전체 내용이 공개된 가이드북을 제공합니다.

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베타 다양성
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